在《郑成功》电影中，最离谱的一段就是当郑成功要收复台湾的时候，北京的满清皇帝说让围困厦门的清军后撤三百里，让郑成功安心收台。而真实历史上，满清皇帝可是和洋人深度合作，共同镇压郑氏的。
虽然郑家确立了海上霸主的地位，但17世纪中国发生了巨大的变动，清军入关，随即南下，在1646年抵达福建，郑芝龙旋即降清。其子郑成功因而和父亲决裂，并在福建沿海坚持扶明抗清。政权的对立，决定了清朝必须消灭郑家。决裂之初，郑成功势力非常弱小，金门被郑彩占据，厦门被郑洪奎占据。直到1650年，郑成功才成功将金夏整合。到1658年，郑成功发动光复南京作战时，郑家势力达到顶峰。
光复南京作战失败后，郑成功在战略上陷入被动。1660年，西南永历政权也濒临崩溃。郑成功的根据地只有金、厦，为了开辟新根据地，郑成功决心收复台湾。至1662年2月，在台荷兰人向郑成功投降，荷兰对台湾38年的殖民统治结束。但荷兰人并没有死心，还时刻想着重新占据台湾。而此刻郑家西占据金、厦，东占据台湾，台湾海峡成了郑家内海，台湾也有力地支持了前线抗清。在这种情况下，荷兰要卷土重来，满清要消灭明郑。台海之上再起风云。
15世纪后，世界进入大航海时代，西洋人频繁出没于东亚海域。1602年荷兰成立东印度公司，总部在巴达维亚（今雅加达）。1624年，荷兰占据中国的台湾。而此刻正处于明末，东南海盗迭起，海盗集团中以郑芝龙的“十八芝”为翘楚，郑芝龙以海盗为本业，兼营走私贸易，这就和热衷通商的荷兰产生了矛盾。1633年，郑芝龙和荷兰之间爆发了金门料罗湾海战，结果世界强国荷兰被郑家水师击败。此后郑家垄断了以中国为核心的东洋贸易，连西洋人过路都得给郑家交保护费。
外敌窥伺之下，郑氏内部也出现了巨大变动。大明国姓爷、民族英雄郑成功于1662年6月病逝。